药物进入体内以后经过两种方式进行清除:排泄或者代谢成为一种或多种活性或无活性代谢产物。当药物主要通过代谢进行清除时，代谢途径可显著影响药物的安全性、疗效及用法。当药物通过单个代谢途径进行清除时，代谢速率的个体差异可导致血液和组织中的药物和代谢产物浓度出现巨大差异。在某些情况下，差异呈现双峰分布，提示存在遗传多态性(如CYP450 2D6、CYP4502 C19、N-乙酰基转移酶)。当遗传多态性影响到清除的重要代谢途径时，可能需要对剂量进行较大调整，以达到安全和有效地应用药物的目的。遗传药理学已经影响了临床用药。例如，主要通过CYP4502D6代谢的某种药物，约7%的白人不能代谢该药物，而其他人种的相应比例通常低得多。其他途径(主要为CYP450 2C19和N-乙酰基转移酶)也存在类似情况。同样重要的是(如果不是更重要的话)，合并用药能够抑制或诱导许多酶代谢清除途径，包括大多数经CYP450酶代谢清除的途径。因此，合并用药可导致某一个体的治疗情况发生突然改变。这种药物相互作用可导致血液和组织中的药物或代谢产物浓度出现显著降低或升高，或导致毒性物质蓄积(如某些抗组胶药一抗真菌药之间的相互作用)。这些类型的变化可作为一种重要方式使新药(尤其是治疗窗窄的药物)的安全性和疗效发生改变。
对于血药水平变化莫测而使其毒性水平无法被接受药物，了解其代谢途径和潜在相互作用，有时可允许这些药物的临床试用。因此，在研发早期弄清楚药物主要是通过原形药排泄还是通过一种或多种代谢途径进行清除是至关重要的。如果药物主要通过代谢进行清除，则应知道主要代谢途径，这一信息将有助于认识个体间和个体内代谢差异的意义及某些药物间相互作用和其他相互作用的重要性。这类信息还将有助于确定是否应进一步探索某些代谢产物的药理学特性。
本FDA行业指导原则提出了有关当前药物代谢和相互作用体外研究方法的建议。本指导原则旨在鼓励在可行和适当情况下，对体外代谢和相互作用进行常规全面的评估。如所有FDA指导文件一样，这些建议并非必须遵循，而是向药物研发人员提供一种参考，用于解决潜在的重要安全性问题。FDA认识到，任何方法的重要性会随着药物研发及其预期的临床用途而变化。FDA还认识到，临床观察能够解决一些本文件所探讨的体外研究中的相同问题。但就提供的信息广度而言，本文件中建议的方法有效且成本较低，并且这些方法通常能够减少或取消进行进一步临床观察的必要。本特定指导原则针对的药物类别较广:分子量小于10000道尔顿的分子。
尽管药物代谢和药物相互作用体外研究领域的充分发展使本指导原则得以成功编写，但是还需要开展进一步工作，以全面表述体外药物代谢(包括诱导和抑制)及其对后续临床研究和产品说明书的意义。由于药物代谢体外研究是药物开发和法规方面一个发展迅速的领域，因此本指导原则可能需要定期修订。
长期以来，FDA审评专家一直对药物安全性和疗效方面的药物代谢和药物间相互作用的影响感兴趣。因此，有关该主题的讨论也见于其他FDA指导原则文件，包括《药物临床评价的一般考虑(General Consideration for Clinical Evaluation of Drugs;FDA 77-3040)、《老年人用药研究指导原则(Guideline for Studying Drugs Likely to be Used in the Elderly;11/89)、《药物临床评价中性别差异的研究和评价指导原则(Guideline for the Study and Evaluation of the Gender Difference in the Clinical Evaluation of Drugs;58 FR 39406，1993，7月22日)。欲获得这些文件，请联系药物评价与研究中心的药物信息室。
